Im Jahr 1993 gründete man den Verein aus den Stammvereinen SC Bodenfelde und TSV Lippoldsberg. Ziel war es, ein gemeinsamen leistungsstarken Club im Weserbergland zu installieren. Zwischenzeitlich gehörte der TSV Wahmbeck den Weseranern an. Diese trennten sich nach ein paar Jahren freundschaftlich wieder und spielen wieder eigenständig in enger Nachbarschaft. Im Jahr 2012 bekam man mit dem FC Vernawahlshausen einen weiteren Stammmverein und vergrößerte den FC Weser.
Mit der Damenmannschaft, zwei Herrenteams und einer Altherrenmannschaft sind wir im Fußballkreis Northeim/Einbeck vertreten. Die Damen spielen momentan in der Kreisliga des Fußballkreises Göttingen/Osterode, da der eigene Fußballkreis keine eigene Staffel besetzen kann. Die 1.Herren spielt unter Trainer Oliver Bornemann in der Kreisliga. Das Trainergespann Lobitz/Harenkamp leitet die Geschicke der 2. Herrenmannschaft in der 1.Kreisklasse und Detlef Schlieper dirigiert die Altherren, ebenfalls in der Kreisklasse der Altherrenliga.
In der Jugend bildet man, gemeinsam mit der SG Heisebeck/Offensen, die JFG Weser/Schwülme. Wir können von den Bambini, bis zu B-Junioren (U17) alle Altersklassen besetzen und spielen auch hier im Fußballkreis Northeim/Einbeck.